因此，在被授予元帅之后，孙承宗对于总参谋部的具体事务就很少再进行干涉，倒是差不多成了皇帝的传话筒。

在这样的局势下，刚刚加入总参谋部不久的孙传庭和卢象升，很快就同茅元仪分庭抗礼了起来。茅元仪在武官面前倒是毫无畏惧的心理，但是进士出身的文官面前，他总是下意识的想要退让三分。在袁崇焕面前他是这样，在孙传庭和卢象升面前，他也依然如此。

一场总参谋部的临时会议，倒是让崇祯很清楚的看到了总参谋部内在的权力支配派系。对于茅元仪在会上表现出来的无主见，让朱由检在心里也是大为摇头。他不由对茅元仪下了个定论，此人做一做行政事务，编写规范条文还不错，让他独当一面，大概还不及袁崇焕。虽然袁崇焕行事过于独断专行，但是对军事行动来说，最坏的决定也好过没有决定。

茅元仪领兵，一旦失败必然不可收拾，而袁崇焕大概还能把败军带回来一部分，两人的差别大抵就是如此了。

至于孙传庭和卢象升两人，前者虽然能够顾全大局，但是套用一句后世比较流行的话语进行评论，那就是他身上具有一种小资产阶级的软弱性。所以看到陕西平叛的报告后，第一时间想到的，就是维持当地稳定的局势，即便这种稳定已经损害到了总参谋部制定军纪的原则性。

至于卢象升，则是太过于刚正，对于违反军纪的贺人龙、艾万年两军将士，丝毫不考虑任何特殊情况，一心想要严明朝廷的法纪。

了解了总参谋部成员们的态度后，朱由检思考了片刻，便对着一边的孙承宗说道：“孙先生，朕看孙、卢两位参谋说的主张，都有一定道理。不如这样，朕也说说自己的意见，然后你们再讨论一下，争取尽快拿出一个办法，我们总不能让陕西平乱将士陷入不安，到时陕西的局势就更难收拾了。”

孙承宗对着皇帝点了点头说道：“还请陛下训下，臣等都聆听陛下的想法，也好让讨论有个方向。”

朱由检这才转头，扫视了一眼会议桌前就坐的参谋们，方才缓缓说道：“朕觉得，卢卿说的还是对的。大家都想一想，朝廷为什么是朝廷，就是因为朝廷掌握了执政之权，没有执政之权，就不会有所谓的朝廷。执政之权，就是政权。什么是政权，就是镇压之权。朝廷如果没有镇压不服王令的地方之权，又凭什么可以号令天下，施政于四方？朝廷依靠什么来镇压四方，不就是依靠于军队吗？如果朝廷制定的军纪约束不了军队，那么我们还怎么依靠这只军队去镇压反对朝廷的地方势力？那不就是藩镇重现吗？所以，军队是国家最重要的柱石，没有军队的朝廷，就不能称之为朝廷。因此，此次陕西、山西的地方军队违背军纪的行为，必须要得到惩戒，否则就不足以彰显朝廷现在对军队还是有控制能力的，这比区区一两只地方军队的反叛更具危险性。”

听到崇祯这么说，卢象升紧绷的脸顿时放松了下来，虽然他极力坚持自己的主张，但是在参谋部内支持他的人却不多，如今得到了皇帝的支持，他自然觉得事情也许还有转机，可以为无辜被杀的平民讨还公道。

不过就在孙传庭按捺不住，想要对崇祯说点什么的时候，朱由检却又改变了口风说道：“……但是，我们也应当看到。地方军队不守军纪，并不是从朕登基开始的，而是很久之前就已经出现了。边军也好、卫所军也好，这些军队的腐化，都是先从军官克扣军士口粮和饷银开始，上行下效之下，这才有了军队出征时的难以约束。