更何况林丹汗自认他对于明国抵抗后金的军事作战，可谓是尽心尽力。结果明军却次次被后金军队所击败，甚至还牵连的他在辽东都待不下去了。现在他暂时避开后金的锋芒，想要把蒙古右翼各部掌握在手中，先增强察哈尔本部的力量，恢复了实力再打回辽东去，可是明国居然又站出来阻扰自己，实在是有些过河拆桥的意思。

林丹汗于是决定要好好的教训一下明人，让那些明人知道，蒙古人之间的战争，明人还不够资格插手。但遗憾的是，林丹汗策划的这场彻底击败蒙古右翼部族联军，并给明人一个深刻教训的战争，最后居然失败了。

这场战争的失败极大的动摇了林丹汗的威望，特别是不少根基还在辽河套草原上的部族，听闻了后金军队击败了察哈尔部留守在辽河套地区的多罗特部，尽收察哈尔部在辽河套留守部众的消息后，更是人心思归，想要从后金手中夺回自己的族人。

于是察哈尔部族的蒙古亲贵们很快便分成了三个派系，一个是想要打回辽东去；一个是想要在土默特川长久的居住下去；还有一个则是想要继续往西，进入到水草丰饶的青海地区，远离后金的威胁。

打回辽东去的蒙古亲贵人数最少，想要在土默特川定居下去的者仅次于想要继续西迁的蒙古亲贵。之所以想要西迁的蒙古亲贵人数最多，一方面是他们希望能够远远避开后金军队的骚扰，后金军队想要进攻青海就要通过明国的甘肃、宁夏两地，因此他们想要追击到青海大约是不太可能了。

另一方面则是察哈尔部被右翼部族联军同明军联手击败，明人又继续在经济上封锁察哈尔部据有的归化城的话，察哈尔部不仅没有达到西迁的目的，远离战火，休养生息。还需要同时面对后金、蒙古右翼各部和明人的敌对，这显然比在辽东时更为不利。

反倒是迁往了青海之后，察哈尔部还能通过藏巴汗的关系获得一些物资上的支援。现任的藏巴汗噶玛丹迥旺波，为了抵抗格鲁派同卫特拉蒙古的联盟，已经数次派人同林丹汗进行了接触，试图和他结盟共同反对黄教。

黄教，也就是格鲁派早在万历六年就同土默特俺答汗在西海之畔的仰华寺结成了神圣同盟。俺答汗尊索南嘉措为圣识一切瓦齐尔达喇达赖喇嘛，而索南嘉措则称俺答汗为忽必烈的化身，以忽必烈的尊号赠俺答汗。

因为有着这层关系，所以漠南蒙古右翼和左翼三万户信奉黄教的部众极多，而四世达赖云丹嘉措就是俺答汗之曾孙。

林丹汗是布延彻辰汗的长孙，而布延彻辰汗就是被俺答汗所逼迫，被迫迁往辽东的蒙古各部宗主察哈尔部的首领。

也就是说，林丹汗如果承认了黄教，无疑就是等于认同了俺答汗同黄教的神圣同盟，认可了俺答汗是忽必烈的化身，土默特部便享有了同察哈尔部相等的地位，这对于林丹汗来说是不可接受的存在。