森船长无法理解菊地主厨的背叛行为。他自认为自己是菊地主厨的伯乐，没有他，菊地主厨不知道得被欺负到什么情况。他认为是自己和胜利女神号成就了菊地主厨，现在对方出名了，想要单干，就转头把他们踩在脚底。

菊地主厨虽然十分理解森船长的指责，但他自己也无法开口承认，是因为自己逼死师傅的道德愧疚。同时，他也不敢说出真相，以免森船长和他一样背上思想负担，所以只能干巴巴地表示辞职是自己的自由。

森船长是一个精神和感情洁癖，而且他视胜利女神号为自己的生命。菊地主厨的行为，无疑是在他的雷区疯狂蹦迪。森船长一直在劝菊地主厨三思，多为自己和胜利女神号考虑，开店可以，但不能继承前任东家的名号，更不能平反。如果他坚持这样做，大家都会沦为笑柄。

菊地主厨感恩胜利女神号的栽培，权衡再三后，还是选择同意了森船长的建议，直到他在船上遇到了文代女士。

长期以来的懊悔顷刻间压倒了他的精神，他无法再忍受自己的道德谴责。打算在晚宴上公布真相，向文代女士道歉，以此来平反他们一直以来的冤屈。

在他回宴会厅的路上，遇到了正离开房间，拿着工具箱打算前往船长室的森船长，菊地主厨坚定地告诉森船长自己的决定，表示绝不后悔，随后两人便就这个问题吵起来。

森船长无法理解菊地主厨为什么要在这种情况下为前任东家平反，现在是铃木集团的年庆，很多知名记者都在，消息一定会传的沸沸扬扬。而且对本次金主的铃木集团来说，在人家年庆上平反，是非常不礼貌的一个行为，容易得罪对方。

森船长反复劝说菊地主厨放弃，并告诉他这对胜利女神号将是致命的打击。

但菊地主厨心意已决，毕竟如果错过这次机会，他将没有办法能在这么大的场合下帮师傅伸冤，所以拒绝了森船长的请求。

森船长不知道菊地主厨为什么这么坚定，误以为对方就是自私自利，把曾经的恩人用完就丢。见自己多番劝阻无果，便一怒之下，拿起手边的锤头，给菊地主厨来了一击。

发现菊地主厨已死，森船长只好先将尸体放在自己房间的浴缸中，然后前往值班室值班。但此时，由于福山大副担心森船长会发现船上灯泡的质量问题，提前发现火灵教的计划，所以在通知船长后一路跟随他，并看见了菊地主厨进入船长房间的一幕。

他注意到只有森船长一人出门，便通知小田切进房查看，发现尸体的小田切用保洁车收走尸体，藏进了回收间。考虑到晚宴那边需要他在场，福山大副通知完后就返回宴会厅，帮助铃木史郎维持宴会。

福山大副是个虔诚的火灵教信徒，他担心菊地主厨死在仪式之前，无法前往新世界。于是之后，福山大副便前往回收间，焚烧了尸体，完成仪式。

第三个案件，火灵教。

火灵教的奥山主教，他是一个非常走极端的人。他的思想是：如果世界不能如我想象的美好，那么大家都去死吧。

所以他构想出一个可以改变整个世界的灵神，并相信灵神可以创造出一个他梦想中的乐园。如果一旦这个神明不按照他的想法做事，他也就不再信仰这个神明。

打个比方就是，我考试前，买了个柯南海报贴墙上，寓意“挂科难”，我天天对着柯南三拜九叩。但考完，我还是挂科了，所以就一气之下把海报撕了。

奥山主教就是这么个思路。为我所用，听我话的神，才是好神，才是值得我信的神。你不听我话，你不帮我，我就不信你。

所以他有多么极致的爱灵神，就有多么极致的狠和景弥生。因为和景弥生打破了他一切虚构的幻想。所以正常想从他嘴里套话是不可能的，于是和景弥生才用梦境套话。

火灵教的计划很简单，就没有什么好多说的了，正文应该都很清楚了。补充一个设定，“无私慈爱的灵神，在此向您献上祭品，请引导无知者的灵魂，使它去往您的身边”这个祈祷的对象，其实是奥山主教本人，而不是灵神。

接受权柄之后，奥山主教在某种意义上，已经成为了半神，拥有能够聆听信徒祈愿的能力。他听到有人念祷告，就会启动那个人身边的徽章，所以徽章才会起火，就这么简单。

而他要搞死火灵圣子教的原因也很简单。火灵圣子教的祈祷对象不是灵神，而是火灵圣子，也就是说，他们的祷告不通往奥山主教。奥山主教没办法用徽章控制他们，所以他要除掉火灵圣子教。

另外，奥山主教的权柄只是空间，这个空间包含着他自己灵魂的位移。但吞噬掉佩戴项链原主人灵魂的原因，是因为原罪。奥山主教可以随意在佩戴项链的人之间穿梭自己的灵魂，但他呆的太久了，原主人就会被原罪拖死。

原主人可以看见和听见奥山主教说话，所以中山翔泰（山王祭凶手）才觉得自己疯了，老是听到有人说话。顺便一提，他们三个的名字都有带着翔字（中山翔泰、观月翔宇、桂木翔野），是因为其实他们都是被火灵教收养的孤儿。

而和景弥生说船上只有3175人，是因为桂木翔野已经被奥山主教侵染，灵魂被原罪吞噬，变成提线木偶的状态。所以和景弥生只能查看到3175人的灵魂，但铃木史郎告诉他，船上有3176人。这个时候，和景弥生就发现了查特黄的问题。

接着是三条暗线，最简单，但最长的是赤井线：

FBI在这本书开始的时间点（即塔纳托斯被召唤前）就已经在查火灵教的问题。美国有很多人失踪，FBI发现失踪的人，都有一位信仰火灵教的关系密切之人。

但火灵教查不出任何问题，他们只好顺着火灵教，查和火灵教相关的其他人。这就查到了远藤晋三头上，FBI发现他们两者之间最近来往密切，于是派在日本，且还是同一个学校的赤井秀一接近远藤晋三。

可赤井秀一刚接了任务，就发现远藤教授几天前已经被害。当时柯南告诉他，凶手应该是名叫安东弥生的学生。现在唯一的线索中断，赤井秀一只能接近安东弥生，打探他的情报。

后面安东弥生被组织换了身份，找不到安东弥生的赤井秀一，只能找柯南要了情报。柯南担心和景弥生对自己不利（理发店案），光速把和景弥生信息告知给赤井秀一，赤井秀一重新接近和景弥生。

和景弥生没有察觉异常，几次接触后和赤井秀一成为朋友，为了感谢他的帮助，还给赤井秀一施加了赐福。而后赤井秀一被FBI发现身上的异常，干脆直接送去火灵教卧底。

奥山主教其实从一开始就发现了赤井秀一的不对劲，但他想知道到底为什么赤井秀一身上有非科学的情况出现，所以一直把他留在身边。为了测试赤井秀一的能力和背后的组织，奥山主教安排赤井秀一去解决火灵圣子教，并最终确定赤井秀一身后为FBI。

奥山主教为了威胁赤井秀一，故意在他面前揪出FBI的其他卧底，然后启动徽章，活活烧死了一位FBI探员。赤井秀一察觉到奥山主教的警告，同时担心自己报告给FBI会让所有持有徽章的人陷入危险，所以迟迟不敢行动。

朱蒂发现赤井秀一的异常，执意用假身份上船，想看看到底发生什么事情。第一天赤井秀一当时用假身份接头，找的就是朱蒂。朱蒂把卫星电话给了赤井秀一，并约定了见面时间和暗号。

可后面赤井秀一逐渐意识到火灵教的计划，考虑到朱蒂手上肯定不止一个卫星电话，如果他告诉朱蒂，朱蒂肯定会告诉FBI，那到时候外面那么多火灵教的信徒就全得死，他不敢去赌。

第一天上船时，他也注意到小田切的发言，意识到小田切有问题，他果断选择劝说小田切倒戈。得益于小田切本来就不太认同这个方案，加上和景弥生的赐福，赤井秀一成功拉弄小田切到己方阵营。

第二条暗线是安室透，他的故事在正文里面说的差不多了。

因为组织里面的“灵异”事件，琴酒接手了墨田组的任务，后面因为和景弥生家里摄像头被拆，作为情报的交换条件，安室透从琴酒手上要走了这个任务。

接到任务后，安室透就开始受到追杀，而且是很密集的追杀。（嗯……因为景光的线主要连在透子身上，所以他会很倒霉）被逼到连觉都没得睡的安室透，无奈之下选择上船避难，同时打算让公安帮他查一下。

上船后，公安打电话告诉他，本田组疑似和火灵教有交易，而火灵教主教正在他所在的船上。然后安室透在吃自助餐的时候看见了隔壁酒吧的桂木翔野，一个被组织判定为失踪的代号成员。颇感奇怪的安室透便离席跟踪对方，看见他和土屋佳辉在秘密交谈。